Ο Mario Botta γεννήθηκε στο Μεντρίσιο του Τιτσίνο την 1η Απριλίου του 1943. Μετά τη μαθητεία του στο Λουγκάνο, πήγε πρώτα στο Art College του Μιλάνου και στη συνέχεια σπούδασε στο University Institute of Architecture στη Βενετία. Υπό τις οδηγίες των Carlo Scarpa και Giuseppe Mazzariol, πήρε το πτυχίο του το 1969. Κατά την παρουσία του στη Βενετία, είχε την ευκαιρία να γνωρίσει και να εργαστεί για τους Le Corbusier και Louis I. Kahn.
Η επαγγελματική του δραστηριότητα ξεκίνησε το 1970 στο Λουγκάνο. Από τότε έχει διδάξει εκτεταμένα, δίνοντας ομιλίες, κάνοντας σεμινάρια και μαθήματα σε πολλές σχολές Αρχιτεκτονικής στην Ευρώπη, την Ασία, τις ΗΠΑ και τη Λατινική Αμερική. Υπήρξε επισκέπτης καθηγητής στο Polytechnic Institute της Λωζάνης το 1976 και στο Yale School of Architecture στο Νιού Χέιβεν το 1987. Το 1983 έγινε καθηγητής των Swiss Polytechnic Schools. Από το 1982 ως το 1987 ήταν μέλος του Swiss Federal Commission of Fine Arts.
Ξεκινώντας με μονοκατοικίες στο Τιτσίνο, η εργασία του αναπτύχθηκε ώστε να περιλαμβάνει και άλλα είδη κτιρίων, όπως σχολεία, τράπεζες, διοικητικές υπηρεσίες, βιβλιοθήκες, μουσεία και λατρευτικούς χώρους.
Τα πιο ξεχωριστά έργα του κ. Botta είναι το San Francisco Museum of Modern Art, ΗΠΑ, το Cathedral of the Resurrection στο Εβρί της Γαλλίας, το Museum Tinguely στη Βασιλεία της Ελβετίας, η Cymbalista Synagogue και το Jewish Heritage Center στο Τελ Αβίβ του Ισραήλ, η Central Library του Ντόρτμουντ στη Γερμανία, το Museum of Modern and Contemporary Art of Trento and Rovereto (MART) στο Ροβερέτο της Ιταλίας, ο Kyobo Tower και το Leeum, Samsung Museum of Art στη Σεούλ της Ν. Κορέας, τα γραφεία Tata Consultancy Services στο Νέο Δελχί και το Χιντεραμπάντ της Ινδίας κι η εκκλησία Papa Giovanni XXIII στο Σεριάτε της Ιταλίας, η αποκατάσταση του Teatro alla Scala στο Μιλάνο της Ιταλίας, η εκκλησία Santo Volto στο Τορίνο της Ιταλίας και το Tschuggen Bergoase Wellness Centre στην Αρόζα της Ελβετίας, το Bechtler Museum of Modern Art στη Σαρλότ των ΗΠΑ, τα γραφεία της Campari κι οι οικίες στο Σέστο Σάντο Τζοβάνι της Ιταλίας, η βιβλιοθήκη του Tsinghua University και το Tsinghua University Art Museum στο Πεκίνο της Κίνας και τα σχέδια της αστικής περιοχής Ex Appiani στο Τρεβίζο της Ιταλίας, το Twelve στο ξενοδοχείο Hengshan στη Σανγκάη της Κίνας και το πρόσφατα εγκαινιασμένο Fiore di Pietra Restaurant στο Μόντε Τζενερόζο της Ελβετίας.
Η δουλειά του έχει αναγνωριστεί παγκοσμίως και έχει παρουσιαστεί σε πολλές εκθέσεις. Ο κ. Botta είναι επίτιμο μέλος σε πολλά πολιτιστικά ιδρύματα, όπως και επίτιμος καθηγητής σε διάφορα πανεπιστήμια στην Αργεντινή, την Ελλάδα, τη Ρουμανία, τη Βουλγαρία, τη Βραζιλία και την Ελβετία.
Το 1996, ο κ. Botta ήταν ιδρυτής και ο άνθρωπος κλειδί της Αρχιτεκτονικής Ακαδημίας στο Μεντρίσιο, εκεί που συνεχίζει να διδάσκει και ήταν πρύτανης από το 2002 ως το 2003 και ξανά το 2011-2013.
Με αφορμή την αφοσίωσή του στην προώθηση του πολιτιστικού διαλόγου για την αρχιτεκτονική, έχει σχεδιάσει το Teatro dell’Architeturra στο Μεντρίσιο της Ελβετίας, που άνοιξε τον Οκτώβριο του 2018.